Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms