Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDCA3Q99618 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms