Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP19Q99542 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP19Q99542 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms