Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UHRF1Q96T88 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UHRF1Q96T88 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms