Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDRT15Q96T59 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDRT15Q96T59 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms