Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRBNQ96SW2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRBNQ96SW2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms