Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
SIN3AQ96ST3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SIN3AQ96ST3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms