Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ALS2Q96Q42 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALS2Q96Q42 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms