Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP3Q96P20 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP3Q96P20 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms