Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms