Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
YTHDC1Q96MU7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms