Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAM20AQ96MK3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM20AQ96MK3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms