Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC114Q96M63 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms