Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC74BQ96LY2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC74BQ96LY2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC74BQ96LY2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC74BQ96LY2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC74BQ96LY2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC74BQ96LY2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms