Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPNS2Q96L46 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms