Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCHS1Q96JQ0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCHS1Q96JQ0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms