Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC11Q96J66 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC11Q96J66 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms