Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGSM3Q96HU1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGSM3Q96HU1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGSM3Q96HU1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGSM3Q96HU1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGSM3Q96HU1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGSM3Q96HU1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGSM3Q96HU1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGSM3Q96HU1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGSM3Q96HU1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGSM3Q96HU1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGSM3Q96HU1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGSM3Q96HU1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGSM3Q96HU1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGSM3Q96HU1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGSM3Q96HU1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGSM3Q96HU1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGSM3Q96HU1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGSM3Q96HU1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGSM3Q96HU1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGSM3Q96HU1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms