Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX27Q96GQ7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms