Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms