Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms