Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKL1Q969V6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKL1Q969V6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms