Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SNX21Q969T3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX21Q969T3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms