Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAVIN3Q969G5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAVIN3Q969G5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms