Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSR2Q969E8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms