Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

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Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
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PTPRUQ92729 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
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PTPRUQ92729 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
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PTPRUQ92729 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRUQ92729 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRUQ92729 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
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