Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABGGTAQ92696 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABGGTAQ92696 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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