Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STAG1Q8WVM7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STAG1Q8WVM7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
STAG1Q8WVM7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STAG1Q8WVM7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STAG1Q8WVM7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STAG1Q8WVM7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STAG1Q8WVM7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STAG1Q8WVM7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STAG1Q8WVM7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STAG1Q8WVM7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STAG1Q8WVM7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STAG1Q8WVM7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STAG1Q8WVM7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STAG1Q8WVM7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms