Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC107Q8WV48 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms