Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTT0

CLEC4C, C-type lectin domain family 4 member C, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4CQ8WTT0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLEC4CQ8WTT0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLEC4CQ8WTT0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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