Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX29Q8TEQ0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX29Q8TEQ0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms