Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC41.02■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.15
RB1CC1Q8TDY2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
RB1CC1Q8TDY2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms