Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMO3Q8TAP4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO3Q8TAP4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms