Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PATJQ8NI35 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms