Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM58Q8NG06 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms