Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA4Q8NEY3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1008.6 ms