Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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ZNF548Q8NEK5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF548Q8NEK5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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