Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE23Q8NDY6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHE23Q8NDY6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms