Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBS3

SLC4A11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A11Q8NBS3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A11Q8NBS3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A11Q8NBS3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms