Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBI5

SLC43A3, Solute carrier family 43 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3Q8NBI5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC43A3Q8NBI5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC43A3Q8NBI5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms