Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MFSD2AQ8NA29 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MFSD2AQ8NA29 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MFSD2AQ8NA29 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MFSD2AQ8NA29 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MFSD2AQ8NA29 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MFSD2AQ8NA29 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MFSD2AQ8NA29 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MFSD2AQ8NA29 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MFSD2AQ8NA29 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MFSD2AQ8NA29 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms