Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PNPLA1Q8N8W4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PNPLA1Q8N8W4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PNPLA1Q8N8W4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PNPLA1Q8N8W4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PNPLA1Q8N8W4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PNPLA1Q8N8W4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA1Q8N8W4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA1Q8N8W4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA1Q8N8W4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA1Q8N8W4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA1Q8N8W4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA1Q8N8W4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA1Q8N8W4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA1Q8N8W4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA1Q8N8W4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA1Q8N8W4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA1Q8N8W4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA1Q8N8W4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNPLA1Q8N8W4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms