Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL3Q8N8U3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms