Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD12Q8N8I0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD12Q8N8I0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms