Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBR7Q8N806 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBR7Q8N806 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms