Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms