Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLDN19Q8N6F1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLDN19Q8N6F1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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