Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHCHD4Q8N4Q1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHCHD4Q8N4Q1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
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