Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD35Q8N283 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms