Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCML4Q8N228 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCML4Q8N228 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms